LEEE spolupracuje interně s odbornými katedrami FEL ČVUT v Praze (zejména fyziky a měření) a externě s komerčními i akademickými pracovišti a snaží se o jejich vzájemné propojování.

Konkrétně nejintenzivněji spolupracuje s Akademií věd ČR s Ústavem jaderné fyziky, v. v. i. a jeho Oddělením dozimetrie záření, Ústavem makromolekulární chemie a jeho vědeckým oddělením Polymery pro optoelektronické a energetické aplikace, Vysokou školou chemicko-technologickou a Vysokým učením technickým v Brně a jeho Fakultou elektrotechniky a komunikačních technologií. Z externích pracovišť potom s firmou Chemcomex, a.s.

Ze zahraničních konkrétních partnerů kooperujeme s francouzskou firmou SEFTIM a německým koncernem Dehn and Söhne.